38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3498 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  39.11 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  38.06 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  36.84 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  40.53 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  35.47 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  34.55 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  33.2 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  38.07 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  33.73 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  34.4 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  33.2 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  36.16 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  36.12 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  34.4 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  32.66 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  33.2 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  32.8 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  32.8 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  39.24 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  33.2 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  37.16 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  32.8 
 
 		 197 aa  90.1  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  37.97 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  25.3 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  38.51 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  28.48 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  27.27 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  27.27 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  27.45 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  26.62 
 
 		 368 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  30.43 
 
 		 417 aa  49.3  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  25.97 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  27.56 
 
 		 428 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  28.74 
 
 		 297 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  30.92 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>