28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0093 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  98.64 
 
 
245 aa  303  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  97.28 
 
 
245 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  97.28 
 
 
245 aa  298  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  87.07 
 
 
245 aa  261  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  87.07 
 
 
245 aa  261  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  66.67 
 
 
250 aa  204  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  65.99 
 
 
251 aa  201  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  64.63 
 
 
251 aa  197  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  61.84 
 
 
252 aa  191  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  57.82 
 
 
247 aa  169  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  52.08 
 
 
246 aa  158  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  49.32 
 
 
246 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  45.83 
 
 
246 aa  134  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  45.03 
 
 
246 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  47.22 
 
 
244 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  42.66 
 
 
242 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  49.56 
 
 
219 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  39.58 
 
 
243 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  35.42 
 
 
234 aa  86.3  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  36.77 
 
 
232 aa  84  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  39.31 
 
 
232 aa  80.1  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  35.42 
 
 
245 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  34.48 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  36.7 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  35.14 
 
 
243 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  30.2 
 
 
244 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  22.52 
 
 
246 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>