35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1891 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  462  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  51.58 
 
 		 234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  42.92 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  50 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  40.53 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  41.44 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  40.93 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  39.3 
 
 		 244 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  42.34 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  39.66 
 
 		 245 aa  124  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  40.69 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  44.85 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  38.33 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  38.79 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  40.39 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  39.3 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  37.66 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  37.23 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  44.38 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  37.5 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  38.42 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  39.49 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  39.02 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  36.02 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  51.18 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  39.31 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  29.15 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  36.69 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  25.3 
 
 		 409 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.414005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  26.67 
 
 		 428 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  24.84 
 
 		 424 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  23.02 
 
 		 424 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  28 
 
 		 417 aa  42  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  23.31 
 
 		 427 aa  42  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  26.62 
 
 		 431 aa  42  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>