31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0611 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  845    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  47.79 
 
 
428 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  51.96 
 
 
407 aa  395  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  45.6 
 
 
431 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  49.88 
 
 
427 aa  378  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  48.8 
 
 
415 aa  360  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  47.91 
 
 
425 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  45.62 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  46.39 
 
 
420 aa  316  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  45.9 
 
 
423 aa  312  5.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  37.77 
 
 
424 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  41.61 
 
 
415 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  37.53 
 
 
424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  42.48 
 
 
460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  37.05 
 
 
424 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  42.73 
 
 
446 aa  297  3e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  37.05 
 
 
427 aa  290  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  34.83 
 
 
417 aa  272  7e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  40.04 
 
 
481 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  34.04 
 
 
450 aa  247  3e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  36.93 
 
 
445 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  33.26 
 
 
409 aa  199  7e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.414005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  34.93 
 
 
413 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  30.44 
 
 
443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  37.6 
 
 
415 aa  169  7e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  30.86 
 
 
407 aa  153  5e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  34.13 
 
 
415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  34.2 
 
 
432 aa  146  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  30.43 
 
 
245 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  29.66 
 
 
338 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  30 
 
 
318 aa  43.1  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>