30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2296 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  828    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.414005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  45.28 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  33.57 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  34.35 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  35.38 
 
 		 445 aa  209  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  35.18 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  31.91 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  33.59 
 
 		 446 aa  203  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  33.26 
 
 		 417 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  30.21 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  32.52 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  33.02 
 
 		 415 aa  186  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  30.75 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  31.84 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  30.59 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  30.9 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  30.71 
 
 		 425 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  32.69 
 
 		 413 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  31.59 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  31.74 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  31.92 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  27.98 
 
 		 460 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  33.01 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  30.88 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  32.93 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  34.14 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  27.67 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  25.3 
 
 		 232 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  38.98 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.183583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>