30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0194 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  833    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  64.2 
 
 
427 aa  525  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  63.12 
 
 
415 aa  514  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  56.58 
 
 
425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  55.77 
 
 
415 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  51.96 
 
 
417 aa  395  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  48.08 
 
 
428 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  45.19 
 
 
431 aa  352  8e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  45.43 
 
 
431 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  46.99 
 
 
423 aa  319  5e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  42.92 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  42.13 
 
 
420 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  38.42 
 
 
424 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  37.38 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  38.33 
 
 
427 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  37.23 
 
 
424 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  38.37 
 
 
446 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  38.94 
 
 
481 aa  259  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  36.04 
 
 
417 aa  256  6e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  33.09 
 
 
450 aa  218  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  34.62 
 
 
445 aa  203  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  33.33 
 
 
409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.414005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  31.84 
 
 
443 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  33.56 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  34.99 
 
 
415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  32.85 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  35.32 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  41.32 
 
 
415 aa  145  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  29.45 
 
 
338 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  25.87 
 
 
318 aa  43.9  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>