40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0100 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  842    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  70.53 
 
 
415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1170  hypothetical protein  68.84 
 
 
415 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.167175  normal  0.830159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0133  hypothetical protein  69.01 
 
 
432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0160  hypothetical protein  42.18 
 
 
407 aa  260  3e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.90474 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  31.16 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0604  hypothetical protein  35.33 
 
 
445 aa  189  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0611  hypothetical protein  34.93 
 
 
417 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.639809  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0928  domain of unknown function DUF1743  34.58 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2296  hypothetical protein  32.69 
 
 
409 aa  172  6.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.414005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  30.59 
 
 
443 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0030  domain of unknown function DUF1743  38.32 
 
 
415 aa  170  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0159  hypothetical protein  35.19 
 
 
415 aa  169  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0989  hypothetical protein  32.39 
 
 
424 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0194  hypothetical protein  33.56 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  37.2 
 
 
427 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1489  hypothetical protein  31.54 
 
 
427 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  32.17 
 
 
428 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1639  hypothetical protein  31.87 
 
 
424 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59407  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0275  hypothetical protein  31.11 
 
 
424 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0976777  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1810  nucleic acid binding protein  30.81 
 
 
431 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0755  hypothetical protein  29.41 
 
 
417 aa  144  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  32.32 
 
 
431 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  31.34 
 
 
423 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.07 
 
 
425 aa  137  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0845  domain of unknown function DUF1743  30.86 
 
 
420 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  35.09 
 
 
460 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0272  domain of unknown function DUF1743  27.79 
 
 
481 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.926897 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  29.41 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  29.41 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  29.41 
 
 
301 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  30.38 
 
 
246 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  30 
 
 
338 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  30.67 
 
 
246 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  32.29 
 
 
762 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  32.72 
 
 
297 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  33.56 
 
 
361 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  30.82 
 
 
296 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  29.73 
 
 
375 aa  43.9  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  29.05 
 
 
318 aa  43.1  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>