34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1816 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  615  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  97.01 
 
 
301 aa  598  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  96.35 
 
 
301 aa  598  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  81.06 
 
 
301 aa  519  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  71.96 
 
 
306 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  37.1 
 
 
297 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0403  hypothetical protein  35.82 
 
 
303 aa  158  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000299403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0536  hypothetical protein  35.92 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2301  hypothetical protein  33.45 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0595  hypothetical protein  33.56 
 
 
298 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.183466 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0229  hypothetical protein  36.88 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  34.13 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  34.4 
 
 
296 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  35.19 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  32.44 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  34.8 
 
 
318 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  31.93 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  26.79 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2291  hypothetical protein  23.94 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  28.3 
 
 
375 aa  62.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  22.58 
 
 
368 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  27.27 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  23.4 
 
 
361 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  24.18 
 
 
232 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  30.92 
 
 
244 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  26.85 
 
 
450 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0100  hypothetical protein  29.41 
 
 
413 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000405594 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  28.21 
 
 
246 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  27.38 
 
 
443 aa  46.2  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.97 
 
 
425 aa  45.8  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  29.68 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0126  hypothetical protein  27.39 
 
 
415 aa  43.9  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0200734  hitchhiker  0.00611159 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2426  domain of unknown function DUF1743  27.45 
 
 
431 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  30.38 
 
 
245 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>