37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1706 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  53.28 
 
 
242 aa  279  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  51.42 
 
 
246 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  46.56 
 
 
246 aa  232  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  46.75 
 
 
246 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  46.96 
 
 
246 aa  218  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  43.27 
 
 
251 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  47.66 
 
 
219 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  42.21 
 
 
245 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  41.8 
 
 
245 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  41.39 
 
 
245 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  41.8 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  40.98 
 
 
245 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  43.27 
 
 
251 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  42.34 
 
 
250 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  41.74 
 
 
247 aa  178  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  36.18 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  36 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  33.2 
 
 
245 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  47.22 
 
 
150 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  36.32 
 
 
232 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  38.2 
 
 
234 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  35.65 
 
 
244 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  40.39 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  36.96 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  35.71 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  34.3 
 
 
243 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  35.2 
 
 
197 aa  98.6  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  30.26 
 
 
301 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  30.92 
 
 
301 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  30.92 
 
 
301 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  32.24 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  29.61 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1790  domain of unknown function DUF1743  26.29 
 
 
423 aa  45.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0094  hypothetical protein  29.55 
 
 
88 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  28.4 
 
 
428 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1178  domain of unknown function DUF1743  26.97 
 
 
460 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>