30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2626 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  52.31 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  53.46 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  49.77 
 
 		 246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  49.3 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  47.66 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  46.3 
 
 		 246 aa  188  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  44.75 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  48.62 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  46.3 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  44.13 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  40.36 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  43.06 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  43.06 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  42.59 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  42.59 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  42.13 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  33.03 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  38.07 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  49.56 
 
 		 150 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  37.79 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  34.45 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  51.18 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  44.78 
 
 		 265 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  41.46 
 
 		 244 aa  92  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  43.31 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  32.99 
 
 		 197 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  45.24 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  26.62 
 
 		 318 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  31.94 
 
 		 318 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>