29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0275 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0275  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00475416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1477  conserved hypothetical cytosolic protein  48.12 
 
 		 244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2075  hypothetical protein  48.95 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  41.44 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2485  hypothetical protein  35.74 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1471  hypothetical protein  44.64 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  35.87 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1532  hypothetical protein  36.65 
 
 		 246 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  41.01 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2393  hypothetical protein  36.51 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  35.71 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2622  hypothetical protein  42.13 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2626  hypothetical protein  44.78 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00360084  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3956  hypothetical protein  29.29 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3863  hypothetical protein  29.29 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4084  hypothetical protein  31.5 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0135  hypothetical protein  40.74 
 
 		 247 aa  95.9  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0135  hypothetical protein  31.78 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0098  hypothetical protein  37.89 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4306  hypothetical protein  28.87 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3672  hypothetical protein  31.13 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4446  hypothetical protein  28.87 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4251  hypothetical protein  28.45 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1804  periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  38.51 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0093  hypothetical protein  34.48 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0606  thiazole biosynthesis protein ThiG  28.81 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2484  hypothetical protein  24.04 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  25.68 
 
 		 375 aa  42.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>