31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1355 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  750    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  56.35 
 
 
368 aa  389  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  56.09 
 
 
361 aa  364  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  49.31 
 
 
375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2291  hypothetical protein  47.8 
 
 
364 aa  338  8e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  27.59 
 
 
318 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  26.79 
 
 
301 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  28.57 
 
 
318 aa  90.5  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  25.56 
 
 
301 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  28.36 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  25.94 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  24.81 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2301  hypothetical protein  28.09 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  26.81 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0595  hypothetical protein  27.88 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.183466 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0403  hypothetical protein  25.78 
 
 
303 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000299403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  26.33 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  28.67 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0536  hypothetical protein  27.17 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  23.3 
 
 
306 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  32.57 
 
 
297 aa  60.1  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0513  hypothetical protein  32.45 
 
 
232 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0696443  normal  0.712396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  26.62 
 
 
245 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  22.5 
 
 
450 aa  53.5  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0229  hypothetical protein  28.12 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1706  hypothetical protein  28.95 
 
 
244 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2319  hypothetical protein  29.61 
 
 
428 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0256  periplasmic binding protein  27.1 
 
 
234 aa  47  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.322099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2348  hypothetical protein  32.9 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1891  hypothetical protein  27.63 
 
 
232 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1234  domain of unknown function DUF1743  21.29 
 
 
443 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>