More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0920 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0920  histidine kinase  100 
 
 
505 aa  1032    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0372  histidine kinase  28.51 
 
 
505 aa  158  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
613 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
614 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
421 aa  150  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
639 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
639 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  35.59 
 
 
617 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
641 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
639 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
377 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
620 aa  144  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
646 aa  143  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
614 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  29.79 
 
 
531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
640 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
579 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  32.5 
 
 
1629 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  32.22 
 
 
461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  32.22 
 
 
461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
958 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  32.51 
 
 
1526 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  31.8 
 
 
461 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
634 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
687 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
763 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
945 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  29.96 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
944 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
3470 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
519 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
827 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 
1038 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  29.67 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
592 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
1043 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
2153 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1026 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
933 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
718 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
1010 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
780 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  32.77 
 
 
935 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  29.36 
 
 
1111 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
932 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
906 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  30.71 
 
 
1003 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
631 aa  127  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
730 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
885 aa  126  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
815 aa  126  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
608 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0404  histidine kinase  34.58 
 
 
466 aa  126  9e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  31.62 
 
 
835 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  28.63 
 
 
810 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  30.21 
 
 
742 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  32.77 
 
 
581 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
503 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  32.05 
 
 
470 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
391 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  32.47 
 
 
576 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  33.33 
 
 
565 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  30.08 
 
 
560 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
1064 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  32.39 
 
 
1016 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
730 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
488 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
2161 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  28.33 
 
 
927 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
464 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
920 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
467 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.2 
 
 
473 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1131 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
568 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
1352 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
1126 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
511 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  33.74 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
589 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
748 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
816 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1331 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  30.9 
 
 
1046 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
894 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
917 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2189  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
729 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.49015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
1287 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  33.05 
 
 
633 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 
816 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
1291 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
581 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
1131 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
436 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
1159 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>