More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1397 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0556  UvrD/REP helicase  72.25 
 
 		 613 aa  907    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128022  normal  0.315576 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3265  UvrD/REP helicase  90.06 
 
 		 624 aa  1151    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0203  UvrD/REP helicase  72.68 
 
 		 614 aa  914    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1397  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 621 aa  1265    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1443  UvrD/REP helicase  73.12 
 
 		 613 aa  882    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.20134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 787 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  23.08 
 
 		 666 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  20.5 
 
 		 664 aa  95.5  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.46 
 
 		 718 aa  94  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  24.02 
 
 		 760 aa  93.2  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.13 
 
 		 841 aa  92.8  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.79 
 
 		 751 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.27 
 
 		 751 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  22.34 
 
 		 735 aa  86.3  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  23.52 
 
 		 726 aa  84.7  0.000000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.88 
 
 		 768 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 		 668 aa  84.3  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.81 
 
 		 757 aa  84.3  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0950  UvrD/REP helicase  24.68 
 
 		 813 aa  84  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000846771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  27.67 
 
 		 720 aa  84  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 753 aa  84  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.38 
 
 		 664 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  26.04 
 
 		 720 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  27.04 
 
 		 720 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1119  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.67 
 
 		 691 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.14 
 
 		 673 aa  82  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 720 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.67 
 
 		 730 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  27.67 
 
 		 720 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1244  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.67 
 
 		 691 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.87 
 
 		 785 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  26.88 
 
 		 678 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.16 
 
 		 743 aa  81.3  0.00000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  26.03 
 
 		 724 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  22.71 
 
 		 723 aa  80.5  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 672 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  26.98 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  26.98 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  26.98 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  26.98 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  26.98 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  26.98 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  26.98 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  26.98 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.56 
 
 		 677 aa  80.1  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  23.42 
 
 		 726 aa  80.1  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.93 
 
 		 658 aa  80.1  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  24.17 
 
 		 723 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.72 
 
 		 729 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.6 
 
 		 781 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.6 
 
 		 781 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.45 
 
 		 670 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 720 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.98 
 
 		 759 aa  78.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0621  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.43 
 
 		 691 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 720 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  22.07 
 
 		 807 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  24.94 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 720 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 720 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 720 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.91 
 
 		 725 aa  79  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 812 aa  78.6  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  23.96 
 
 		 736 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  23.65 
 
 		 687 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  23.79 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  27.08 
 
 		 720 aa  77.8  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  24.55 
 
 		 724 aa  77.4  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  26.51 
 
 		 709 aa  77  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  26.51 
 
 		 709 aa  77  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  21.26 
 
 		 638 aa  77  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  23.43 
 
 		 678 aa  77  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  22.77 
 
 		 666 aa  77  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  24.13 
 
 		 728 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.02 
 
 		 694 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 726 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.62 
 
 		 713 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 826 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  20.35 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  23.98 
 
 		 723 aa  75.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  23.98 
 
 		 723 aa  75.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  23.98 
 
 		 728 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.21 
 
 		 662 aa  75.1  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  23.29 
 
 		 757 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  24.19 
 
 		 727 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  24.76 
 
 		 825 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.18 
 
 		 658 aa  75.5  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  26.41 
 
 		 817 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  22.8 
 
 		 674 aa  75.1  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  23.69 
 
 		 779 aa  74.7  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 		 708 aa  74.7  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.51 
 
 		 748 aa  74.7  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.1 
 
 		 738 aa  74.3  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  24.53 
 
 		 721 aa  74.3  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  23.32 
 
 		 723 aa  74.3  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.81 
 
 		 849 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  21.27 
 
 		 738 aa  73.9  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  22.1 
 
 		 738 aa  73.9  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  27.15 
 
 		 759 aa  73.9  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  22.43 
 
 		 786 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>