More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1443 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0203  UvrD/REP helicase  72.5 
 
 		 614 aa  899    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1443  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 613 aa  1241    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.20134  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1397  UvrD/REP helicase  73.12 
 
 		 621 aa  900    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3265  UvrD/REP helicase  73.79 
 
 		 624 aa  909    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0556  UvrD/REP helicase  76.29 
 
 		 613 aa  956    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128022  normal  0.315576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  25.62 
 
 		 787 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 666 aa  97.8  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  21.8 
 
 		 664 aa  91.3  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.49 
 
 		 664 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  27.11 
 
 		 709 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.63 
 
 		 841 aa  89.4  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 709 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  26.02 
 
 		 723 aa  87.8  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  26.67 
 
 		 720 aa  87.4  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  25.64 
 
 		 720 aa  87  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  21.31 
 
 		 708 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  24.55 
 
 		 724 aa  85.5  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.64 
 
 		 725 aa  85.1  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  24.08 
 
 		 812 aa  84.3  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.62 
 
 		 743 aa  84.3  0.000000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  26.15 
 
 		 720 aa  84.3  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 666 aa  83.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  25.9 
 
 		 720 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.25 
 
 		 751 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  24.44 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  23.39 
 
 		 722 aa  82  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  26.15 
 
 		 720 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  22.39 
 
 		 723 aa  82  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  25.64 
 
 		 720 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  25.64 
 
 		 720 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  25.64 
 
 		 720 aa  81.6  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.74 
 
 		 772 aa  81.3  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.25 
 
 		 751 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  25.64 
 
 		 720 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  25.64 
 
 		 720 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  25.64 
 
 		 720 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  25.64 
 
 		 720 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  25.64 
 
 		 720 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 		 668 aa  80.9  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  23.04 
 
 		 714 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  25.69 
 
 		 726 aa  80.5  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.98 
 
 		 759 aa  80.1  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  25.38 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  22.17 
 
 		 1232 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  25.9 
 
 		 720 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  25.9 
 
 		 720 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  25.9 
 
 		 720 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  25.35 
 
 		 737 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  25.9 
 
 		 720 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  25.9 
 
 		 720 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.41 
 
 		 748 aa  79  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  24.23 
 
 		 734 aa  79.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  25.38 
 
 		 720 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.45 
 
 		 719 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  25.38 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  22.49 
 
 		 723 aa  77.8  0.0000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 708 aa  77.8  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  24.49 
 
 		 727 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  24.5 
 
 		 760 aa  77.4  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  25.64 
 
 		 720 aa  77  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  23.74 
 
 		 721 aa  77  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  23.16 
 
 		 717 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  25.45 
 
 		 753 aa  76.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  23.72 
 
 		 727 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  21.73 
 
 		 754 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  24.45 
 
 		 1032 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.66 
 
 		 766 aa  77  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.67 
 
 		 673 aa  76.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  26.87 
 
 		 717 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.1 
 
 		 710 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.82 
 
 		 757 aa  75.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  25.4 
 
 		 907 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  26.87 
 
 		 724 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  21.3 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  24.74 
 
 		 727 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.08 
 
 		 849 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.24 
 
 		 694 aa  75.5  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  23.57 
 
 		 726 aa  75.5  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  20.5 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  24.19 
 
 		 723 aa  75.1  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 706 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 726 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  24.19 
 
 		 723 aa  75.1  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  24.68 
 
 		 728 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  24.68 
 
 		 688 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  24.94 
 
 		 741 aa  74.7  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  24.7 
 
 		 677 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  24.68 
 
 		 728 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.55 
 
 		 932 aa  74.3  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.21 
 
 		 658 aa  74.3  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  21.57 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  25 
 
 		 669 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.16 
 
 		 669 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1146  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.68 
 
 		 688 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.16 
 
 		 669 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  23.95 
 
 		 817 aa  73.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1384  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  24.68 
 
 		 688 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00158737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  24.48 
 
 		 684 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.62 
 
 		 669 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  27.64 
 
 		 678 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>