204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1331 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1331  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
157 aa  298  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0296477  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3421  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
158 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2059  endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.398481  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3438  translation initiation inhibitor  47.69 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  44.62 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  43.85 
 
 
162 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4278  endoribonuclease L-PSP  49.62 
 
 
165 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17728  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3083  endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.214935  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  42.54 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  44.62 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 
158 aa  85.1  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  40.58 
 
 
154 aa  84.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  40.58 
 
 
154 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  41.09 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  42.31 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  44.36 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  46.38 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  39.85 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  36.23 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  41.04 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  41.09 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  36.5 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 
177 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2711  YjgF family translation initiation inhibitor  34.78 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  39.02 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  35.25 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  41.32 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  34.64 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  34.64 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  37.5 
 
 
409 aa  67.4  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  40.62 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  31.11 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2204  Endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  34.01 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  34.06 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  35.11 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2368  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0738806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  37.69 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  34.38 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>