More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0011 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
431 aa  840    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.343608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  71.46 
 
 
431 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.46 
 
 
431 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.46 
 
 
431 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1072  histidine kinase  32.63 
 
 
354 aa  93.2  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
892 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  34.29 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6083  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
587 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.08 
 
 
687 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
582 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
587 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02406  two-component system sensor protein  31.28 
 
 
461 aa  84  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
588 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
889 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  25.86 
 
 
1526 aa  83.2  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
1352 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1732  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0544412  decreased coverage  0.000497213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  31.17 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  29.5 
 
 
689 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  31.33 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
592 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 
592 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 
823 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
932 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0464  sensor histidine kinase  28.24 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  29.85 
 
 
576 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
763 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
634 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
463 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  30 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  29.34 
 
 
913 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
701 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  32.27 
 
 
512 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.253762  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
892 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  29.61 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
541 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6694  putative two-component system histidine kinase  32.08 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  25.69 
 
 
1342 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 
991 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  28.46 
 
 
1202 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  29.74 
 
 
857 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  35.05 
 
 
492 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  26.18 
 
 
560 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
597 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
425 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  29.14 
 
 
471 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
358 aa  77  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.27635  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  27.16 
 
 
539 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
885 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3803  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
846 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109811  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
458 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  30.66 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
381 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0982529  normal  0.120585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3716  sensor protein KdpD  31.37 
 
 
914 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
586 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  25.64 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  37.93 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.02 
 
 
1051 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
493 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  25.79 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  26.03 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
785 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  26.03 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
599 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3738  histidine kinase  27.23 
 
 
601 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1864  ATPase domain-containing protein  30.29 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  27.05 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
612 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  29.21 
 
 
698 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
718 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
488 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1437  Osmosensitive K channel His kinase sensor  30.14 
 
 
854 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.429266  normal  0.268919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  28.52 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  28.52 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
467 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
851 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
1121 aa  73.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  28.83 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
697 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  28.76 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  40.95 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  27.54 
 
 
885 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
535 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 
613 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
562 aa  73.2  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000280494  hitchhiker  0.000000000000157693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  32.27 
 
 
678 aa  73.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
453 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  26.23 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  29.61 
 
 
551 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>