More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4741 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.77 
 
 
431 aa  830    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
431 aa  833    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
431 aa  833    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587591  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.46 
 
 
431 aa  541  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.343608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1072  histidine kinase  31.6 
 
 
354 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  31.82 
 
 
698 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
892 aa  89.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  35.34 
 
 
512 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
493 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  32.02 
 
 
646 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
889 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  28.62 
 
 
689 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  27.38 
 
 
576 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 
488 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  29.91 
 
 
539 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  32.07 
 
 
356 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02406  two-component system sensor protein  31.9 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1019  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
858 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0833425  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  30.16 
 
 
913 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.82 
 
 
1177 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6083  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 
592 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
592 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
614 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
836 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  30.8 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
866 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
836 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
836 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3601  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
899 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
875 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
608 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  30.53 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  32.05 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  28.51 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
905 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  28.03 
 
 
910 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
479 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1083  histidine kinase  29.65 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  34.55 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
587 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  26.97 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.08 
 
 
1274 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
454 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
912 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  29.79 
 
 
885 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  28.95 
 
 
1111 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
932 aa  73.2  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  29.67 
 
 
595 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
1291 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  25.35 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
662 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  28.68 
 
 
927 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
587 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  28.88 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  23.36 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
654 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  25.28 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
535 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 
1121 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  21.92 
 
 
773 aa  72  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  30.63 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  26.76 
 
 
598 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  30.26 
 
 
1127 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
454 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  24.77 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  30.12 
 
 
857 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1732  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0544412  decreased coverage  0.000497213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2318  sensor histidine kinase  30.74 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  25.36 
 
 
1121 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
850 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  34.11 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  22.95 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
571 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  29.22 
 
 
905 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  29.63 
 
 
894 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1810  PAS sensor protein  25.97 
 
 
829 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  25.09 
 
 
1526 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
584 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  29.63 
 
 
894 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  31.08 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  33.49 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.285122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>