More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02406 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02406  two-component system sensor protein  100 
 
 		 461 aa  911    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.21 
 
 		 463 aa  588  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0287  two-component system, sensor protein  67.04 
 
 		 457 aa  559  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0258  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.59 
 
 		 457 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.818246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  39.61 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4162  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 476 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 487 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 462 aa  250  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4431  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  36.32 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  36.3 
 
 		 499 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 477 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3125  sensor protein QseC  36.03 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 473 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739946  normal  0.0152706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3588  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 474 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 469 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.248447  normal  0.139653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3932  histidine kinase  34.29 
 
 		 474 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  36.04 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6694  putative two-component system histidine kinase  34.8 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  35.39 
 
 		 472 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  34.84 
 
 		 496 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  35.15 
 
 		 517 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  34.83 
 
 		 517 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3492  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 456 aa  217  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 476 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 473 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.547854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 524 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  35.12 
 
 		 463 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  37.18 
 
 		 460 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 515 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  32.8 
 
 		 526 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.18 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  34.3 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 463 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 517 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 517 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 517 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 531 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 461 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  33.71 
 
 		 460 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 		 515 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 460 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  33.93 
 
 		 518 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 501 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  34.65 
 
 		 472 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  33.93 
 
 		 817 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  36.09 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  33.71 
 
 		 523 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  36.09 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0728  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 467 aa  203  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 504 aa  203  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 505 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 505 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  33.18 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  33.48 
 
 		 500 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  33.81 
 
 		 460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.33 
 
 		 475 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  34.65 
 
 		 506 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  33.84 
 
 		 467 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  32.96 
 
 		 467 aa  196  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 476 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  34.74 
 
 		 495 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  34.21 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 485 aa  193  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 469 aa  193  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 509 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 480 aa  192  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  34.28 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  34.28 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  34.28 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  34.28 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  34.28 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 501 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 497 aa  189  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 472 aa  189  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  34.6 
 
 		 460 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2516  histidine kinase  31.99 
 
 		 495 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>