40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0992 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 452 aa  917    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  52.79 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  53.5 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  42.99 
 
 		 415 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  45.17 
 
 		 412 aa  349  6e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  44.44 
 
 		 410 aa  343  4e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  43.06 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  42.64 
 
 		 453 aa  328  8e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  42.23 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  42.01 
 
 		 438 aa  323  5e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  41.34 
 
 		 409 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  41.09 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  40.82 
 
 		 383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  39.81 
 
 		 444 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  40.09 
 
 		 427 aa  282  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  36.36 
 
 		 470 aa  276  8e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  35.93 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  35.19 
 
 		 474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  39.77 
 
 		 481 aa  262  8e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  35.14 
 
 		 469 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  35.78 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  34.23 
 
 		 411 aa  195  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  32.34 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  34.16 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  29.09 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  37.01 
 
 		 276 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  32.32 
 
 		 571 aa  109  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  24.86 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  30.26 
 
 		 350 aa  87.4  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.24 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.8 
 
 		 331 aa  54.3  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.37 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.37 
 
 		 333 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1415  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 265 aa  46.6  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334463  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  32.63 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  29.49 
 
 		 233 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  32.91 
 
 		 310 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  32.91 
 
 		 338 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  26.58 
 
 		 335 aa  43.5  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>