27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29419 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  35.97 
 
 		 444 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  36.57 
 
 		 457 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  33.59 
 
 		 481 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  36.47 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  34.7 
 
 		 453 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  37.01 
 
 		 452 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  32.68 
 
 		 470 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  32.68 
 
 		 474 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  32.68 
 
 		 469 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  32.68 
 
 		 470 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  33.74 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  34.63 
 
 		 438 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  33.98 
 
 		 431 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  32.53 
 
 		 571 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  33.61 
 
 		 412 aa  115  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  33.6 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  31.89 
 
 		 415 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  33.33 
 
 		 427 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  29.64 
 
 		 449 aa  112  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  33.08 
 
 		 409 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  31.46 
 
 		 411 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  31.98 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  28.93 
 
 		 411 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  29.46 
 
 		 413 aa  92  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  29.22 
 
 		 411 aa  89.4  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  35.63 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>