30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1771 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 411 aa  827    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  67.15 
 
 		 411 aa  586  1e-166  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  66.67 
 
 		 411 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  64.96 
 
 		 413 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  34.42 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  33.49 
 
 		 401 aa  205  9e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  35.78 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  31.21 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  31.85 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  30.63 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  31.29 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  31.95 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  31.12 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  30.52 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  29.69 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  29.59 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  30.43 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  29.57 
 
 		 470 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  30.41 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  31.42 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  29.41 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  28.44 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  28.94 
 
 		 474 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  30.86 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  29.49 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  30.73 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  31.98 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  30.03 
 
 		 571 aa  95.5  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  21.94 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  29.96 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>