30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1724 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 411 aa  823    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  70.56 
 
 		 411 aa  610  1e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  68.13 
 
 		 413 aa  607  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  67.15 
 
 		 411 aa  586  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  35.81 
 
 		 444 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  33.25 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  32.19 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  31.51 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  31.75 
 
 		 470 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  31.68 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  31.32 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  31.9 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  30.96 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  30.37 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  31.53 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  29.22 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  34.23 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  32.19 
 
 		 453 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  29.98 
 
 		 474 aa  177  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  31.48 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  31.14 
 
 		 410 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  30.44 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  30.07 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  33.13 
 
 		 481 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  30.39 
 
 		 449 aa  156  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  28.93 
 
 		 276 aa  96.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  27.93 
 
 		 571 aa  92.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  22.88 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  31.9 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>