26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1758 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 350 aa  712    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  43.71 
 
 		 370 aa  294  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  32.37 
 
 		 431 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  30.19 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  30.26 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  28.51 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  29.32 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  29.96 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  29.92 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  29.61 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  31.9 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  26.87 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  27.36 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  25.35 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  26.44 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  25.55 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  27.56 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  25.69 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  24.39 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  24.53 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  25.87 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  25.61 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  25.24 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  23.66 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  24.08 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  22.49 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>