34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3230 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 431 aa  879    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  65.5 
 
 		 428 aa  591  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  52.79 
 
 		 452 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  47.43 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  44.95 
 
 		 412 aa  373  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  45.92 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  45.58 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  43.21 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  42.46 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  43.15 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  42.76 
 
 		 449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  40.75 
 
 		 457 aa  332  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  40.57 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  37.45 
 
 		 470 aa  289  6e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  37.95 
 
 		 470 aa  289  7e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  37.5 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  40.24 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  41.5 
 
 		 481 aa  285  8e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  35.73 
 
 		 474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  36.7 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  33.72 
 
 		 413 aa  202  7e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  31.21 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  32.5 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  30.37 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  29.35 
 
 		 401 aa  177  5e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  24.37 
 
 		 381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  33.98 
 
 		 276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  32.37 
 
 		 350 aa  94.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  32.23 
 
 		 571 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  34.19 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  33.9 
 
 		 331 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  34.21 
 
 		 333 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  33.04 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>