30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1254 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 481 aa  980    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  56.67 
 
 		 470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  58.37 
 
 		 470 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  57.73 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  59.05 
 
 		 474 aa  557  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  37.76 
 
 		 428 aa  316  7e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  36.27 
 
 		 431 aa  297  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  42.61 
 
 		 409 aa  293  6e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  41.07 
 
 		 412 aa  285  9e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  39.28 
 
 		 410 aa  277  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  39.66 
 
 		 415 aa  277  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  41.93 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  37.36 
 
 		 438 aa  252  9.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  34.03 
 
 		 452 aa  251  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  36.78 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  39.48 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  34.68 
 
 		 453 aa  239  8e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  32.21 
 
 		 444 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  35.18 
 
 		 457 aa  233  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  36.8 
 
 		 427 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  30.08 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  29.91 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  27.97 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  29.08 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  33.59 
 
 		 276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  26.54 
 
 		 401 aa  129  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  26.22 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  30.31 
 
 		 571 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  23.2 
 
 		 350 aa  57  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  24.4 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>