31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1875 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 410 aa  839    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  68.5 
 
 		 409 aa  568  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  67.51 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  61.48 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  61.03 
 
 		 411 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  46.45 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  45.58 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  45.78 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  44.72 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  43.35 
 
 		 453 aa  333  4e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  44.01 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  45.56 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  44.44 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  41.54 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  40.62 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  41.62 
 
 		 470 aa  279  7e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  39.94 
 
 		 481 aa  276  6e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  40.78 
 
 		 470 aa  276  6e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  41.86 
 
 		 469 aa  275  9e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  36.55 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  31.72 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  31.14 
 
 		 411 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  29.59 
 
 		 411 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  29.61 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  26.45 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  26.92 
 
 		 401 aa  133  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  33.6 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  30.48 
 
 		 571 aa  80.9  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  23.66 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  39.44 
 
 		 239 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>