37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0643 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  100 
 
 		 383 aa  776    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  41.15 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  41.54 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  41.22 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  38.54 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  40.36 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  40.24 
 
 		 431 aa  286  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  41.07 
 
 		 415 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  38.41 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  38.12 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  40.58 
 
 		 452 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  38.69 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  36.98 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  42.65 
 
 		 474 aa  256  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  35.82 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  40.63 
 
 		 470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  40.58 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  40.63 
 
 		 469 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  34.43 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  39.48 
 
 		 481 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  35.48 
 
 		 413 aa  199  6e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  34.07 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  32.19 
 
 		 411 aa  192  7e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  31.85 
 
 		 411 aa  191  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  28.92 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  33.74 
 
 		 276 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  24.1 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  26.46 
 
 		 571 aa  86.3  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  24.52 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  26.44 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  37.68 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.31 
 
 		 331 aa  46.2  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  26.45 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  30.56 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  29.17 
 
 		 359 aa  43.1  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  29.41 
 
 		 333 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  26.45 
 
 		 332 aa  42.7  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>