30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1962 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 412 aa  840    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  66.99 
 
 		 410 aa  570  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  64.63 
 
 		 409 aa  559  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  58.92 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  59.95 
 
 		 411 aa  501  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  45.22 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  44.84 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  47.67 
 
 		 438 aa  358  8e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  45.41 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  45.08 
 
 		 449 aa  339  5e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  45.35 
 
 		 427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  42.49 
 
 		 457 aa  333  5e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  45.33 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  41.19 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  40.87 
 
 		 481 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  43.93 
 
 		 470 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  43.06 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  42.5 
 
 		 470 aa  279  6e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  42.6 
 
 		 474 aa  278  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  37.84 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  32.95 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  31.88 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  31.21 
 
 		 411 aa  189  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  31.58 
 
 		 411 aa  186  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  27.56 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  25.31 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  33.33 
 
 		 276 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  30.09 
 
 		 571 aa  79.7  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  21.79 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  25.24 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>