27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0532 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  100 
 
 		 381 aa  765    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  28.15 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  26.17 
 
 		 415 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  27.2 
 
 		 410 aa  155  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  25.69 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  26.03 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  25.29 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  26.76 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  24.07 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  26.55 
 
 		 470 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  27.25 
 
 		 469 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  26.22 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  25.65 
 
 		 474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  22.36 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  21.81 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  22.93 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  25.35 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  24.12 
 
 		 444 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  24.87 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  21.61 
 
 		 457 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  21.57 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  21.63 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  20.32 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  22.81 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  21.63 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  23.78 
 
 		 452 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>