More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0369 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 		 444 aa  898    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  65.91 
 
 		 439 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  66.89 
 
 		 443 aa  607  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  57.99 
 
 		 440 aa  528  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  58.77 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  58.01 
 
 		 443 aa  527  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  56.36 
 
 		 437 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  56.04 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  56.48 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.81 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.51 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  52.61 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  54.63 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  50.79 
 
 		 449 aa  425  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  47.54 
 
 		 450 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  47.54 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  46.65 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  48.55 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  46.65 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  44.24 
 
 		 442 aa  348  8e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  42.73 
 
 		 433 aa  345  8e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.45 
 
 		 431 aa  344  1e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  42.96 
 
 		 431 aa  342  7e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  42.49 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  43.06 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.69 
 
 		 446 aa  339  5.9999999999999996e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  44.15 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  41.33 
 
 		 513 aa  323  5e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  41.45 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  39.96 
 
 		 561 aa  312  9e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  41.43 
 
 		 591 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  42.52 
 
 		 510 aa  306  5.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  38.53 
 
 		 444 aa  298  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  38.75 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  39.63 
 
 		 447 aa  291  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  39.47 
 
 		 479 aa  289  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  40 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  38.76 
 
 		 450 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.19 
 
 		 446 aa  285  9e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  37.76 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  38.18 
 
 		 476 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  39 
 
 		 542 aa  283  5.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  39.09 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  39.09 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  36.97 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  39.07 
 
 		 525 aa  278  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  39.17 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.91 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  40.09 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  38.95 
 
 		 444 aa  276  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  37.67 
 
 		 447 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.93 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  38.22 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  38.65 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.24 
 
 		 447 aa  269  7e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  38.39 
 
 		 518 aa  269  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.9 
 
 		 507 aa  268  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.5 
 
 		 527 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  38.13 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.52 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2279  signal recognition particle protein  37.33 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000146943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  37.91 
 
 		 495 aa  266  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  38.42 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  37.28 
 
 		 517 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  38.14 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  38.39 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  37.67 
 
 		 508 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  37.64 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  37.76 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  37.7 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.66 
 
 		 530 aa  264  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  38.53 
 
 		 508 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  38.53 
 
 		 522 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  38.36 
 
 		 518 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.35 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  37.78 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.3 
 
 		 449 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  35.19 
 
 		 521 aa  263  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  35.89 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  37.67 
 
 		 449 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.75 
 
 		 481 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  38.55 
 
 		 443 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1006  signal recognition particle protein  36.22 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0974  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  39.67 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  38.92 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  37.88 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  38.04 
 
 		 521 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  36.04 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.03 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.03 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  37.62 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.03 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  40.69 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  38.51 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  38.2 
 
 		 522 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  40.69 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1165  signal recognition particle protein  37.53 
 
 		 532 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  36.61 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  37.56 
 
 		 536 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  37.95 
 
 		 544 aa  259  6e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>