More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1119 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  97.33 
 
 
450 aa  845    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  78.67 
 
 
450 aa  709    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  97.11 
 
 
450 aa  865    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 
450 aa  890    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  91.33 
 
 
450 aa  827    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  49.55 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  48.74 
 
 
443 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  48.36 
 
 
440 aa  425  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  49.06 
 
 
443 aa  425  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  46.74 
 
 
437 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  47.42 
 
 
446 aa  419  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  46.65 
 
 
444 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  47.82 
 
 
449 aa  398  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  46.85 
 
 
441 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  43.11 
 
 
469 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.35 
 
 
446 aa  374  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.7 
 
 
464 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  43.56 
 
 
433 aa  368  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.65 
 
 
464 aa  362  9e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  44.02 
 
 
442 aa  358  9e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.59 
 
 
463 aa  358  9e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  45.19 
 
 
447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.58 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  41.22 
 
 
433 aa  355  8.999999999999999e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.71 
 
 
431 aa  354  2e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  41.38 
 
 
433 aa  349  5e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  42.86 
 
 
431 aa  346  4e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  39.04 
 
 
449 aa  332  7.000000000000001e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  38.72 
 
 
513 aa  325  8.000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.57 
 
 
481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  41.43 
 
 
444 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  39.09 
 
 
510 aa  310  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  40.09 
 
 
561 aa  308  1.0000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  40.18 
 
 
446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  39.77 
 
 
433 aa  305  7e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  39.31 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  41.57 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  36.57 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.57 
 
 
447 aa  303  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  37.53 
 
 
542 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  38.06 
 
 
448 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.9 
 
 
446 aa  296  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  36.26 
 
 
479 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  39.34 
 
 
446 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  39.34 
 
 
450 aa  296  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  38.55 
 
 
444 aa  295  8e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  38.33 
 
 
444 aa  295  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  38.06 
 
 
450 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  38.1 
 
 
443 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  38.62 
 
 
453 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.01 
 
 
449 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  37.5 
 
 
449 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  38.86 
 
 
453 aa  292  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  39.13 
 
 
591 aa  292  7e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  41.43 
 
 
446 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  37.61 
 
 
520 aa  291  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  37.28 
 
 
449 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  38.39 
 
 
453 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  40.61 
 
 
451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.47 
 
 
454 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  38.56 
 
 
461 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  39.22 
 
 
467 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  40.61 
 
 
452 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.76 
 
 
443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  37.95 
 
 
469 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  37.05 
 
 
443 aa  286  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  37.35 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.41 
 
 
496 aa  286  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  37.56 
 
 
453 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  38.82 
 
 
449 aa  286  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  37.83 
 
 
463 aa  285  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  37.3 
 
 
492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  37.3 
 
 
492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  36.89 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  39.67 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  38.02 
 
 
452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  37.79 
 
 
446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  36.24 
 
 
485 aa  284  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  37.59 
 
 
449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  38.62 
 
 
443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  39.43 
 
 
435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  36.67 
 
 
439 aa  283  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  36.05 
 
 
449 aa  283  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  36.4 
 
 
444 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  37.44 
 
 
488 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  36.79 
 
 
521 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.38 
 
 
490 aa  282  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  38.79 
 
 
449 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.33 
 
 
447 aa  282  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  39.86 
 
 
515 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.33 
 
 
452 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  37.59 
 
 
449 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  37.59 
 
 
449 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  37.59 
 
 
449 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  37.59 
 
 
449 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  37.59 
 
 
449 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  36.9 
 
 
492 aa  282  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  37.59 
 
 
449 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.48 
 
 
443 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  36.76 
 
 
442 aa  282  1e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>