More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1226 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  80.72 
 
 		 469 aa  722    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  76.5 
 
 		 463 aa  646    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  100 
 
 		 468 aa  924    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  74.65 
 
 		 464 aa  655    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  76.59 
 
 		 464 aa  651    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  52.23 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  53.71 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  52.58 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  49.34 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  52.21 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  50.89 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  50.79 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  49.1 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  44.55 
 
 		 449 aa  375  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  40.81 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  41.15 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  40.84 
 
 		 450 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  41.43 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  40.49 
 
 		 450 aa  350  4e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  39.53 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.95 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  40 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  40.77 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  38.75 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.26 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  37.33 
 
 		 431 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.62 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  37.35 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  38.3 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  35.38 
 
 		 513 aa  296  7e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  36.24 
 
 		 446 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  37.67 
 
 		 444 aa  293  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  37.36 
 
 		 444 aa  292  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  37.26 
 
 		 479 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  36.78 
 
 		 444 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  37.74 
 
 		 591 aa  286  7e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.64 
 
 		 446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  37.67 
 
 		 447 aa  282  9e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  37.92 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.3 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  37.42 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  37.58 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  37.17 
 
 		 542 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  38.5 
 
 		 445 aa  276  7e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  34.77 
 
 		 439 aa  276  7e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  35.32 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  37.95 
 
 		 476 aa  276  8e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  34.86 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.38 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  34.28 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  35.32 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  35.31 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  36.89 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  36.74 
 
 		 512 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  37.18 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  36.64 
 
 		 521 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.68 
 
 		 481 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  35.36 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  35.41 
 
 		 508 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.21 
 
 		 530 aa  270  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  37.33 
 
 		 536 aa  270  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  37.01 
 
 		 521 aa  269  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  36.17 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  34.31 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.05 
 
 		 515 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.53 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.79 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  34.1 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  38.05 
 
 		 528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  36.2 
 
 		 518 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  36.42 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  35.54 
 
 		 457 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  35.75 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  35.91 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  35.91 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  35.6 
 
 		 448 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.58 
 
 		 443 aa  266  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  36.97 
 
 		 518 aa  266  7e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  33.56 
 
 		 442 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  35.68 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  35.68 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  35.68 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.06 
 
 		 535 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.24 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  36.11 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  34.91 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  35.68 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  35.97 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  35.68 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  34.17 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  37.17 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  36.17 
 
 		 517 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  34.17 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  35.91 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  35.39 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  35.45 
 
 		 449 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  35.45 
 
 		 449 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  37.3 
 
 		 519 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  34.63 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  34.17 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>