More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13417 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  100 
 
 		 510 aa  1043    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  46.76 
 
 		 513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  44.96 
 
 		 591 aa  419  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  45.98 
 
 		 542 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  41.41 
 
 		 561 aa  391  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  41.44 
 
 		 450 aa  326  5e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  39.32 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  39.77 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  42.73 
 
 		 444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  41.52 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  39.87 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  39.32 
 
 		 450 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.05 
 
 		 446 aa  306  8.000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  39.45 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  40.47 
 
 		 446 aa  302  9e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.86 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  40 
 
 		 443 aa  300  6e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  38.82 
 
 		 443 aa  299  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  40.17 
 
 		 437 aa  295  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  39.55 
 
 		 450 aa  294  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.56 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.48 
 
 		 469 aa  280  5e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  37.5 
 
 		 431 aa  276  6e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  37.33 
 
 		 449 aa  276  8e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.79 
 
 		 464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.72 
 
 		 464 aa  272  9e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  36.09 
 
 		 468 aa  269  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.5 
 
 		 463 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  35.87 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.46 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  35.41 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  36.4 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  35.41 
 
 		 433 aa  237  4e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.68 
 
 		 443 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  33.11 
 
 		 450 aa  230  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  34.59 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.89 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  34.9 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  32.97 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  33.48 
 
 		 449 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  32.2 
 
 		 476 aa  223  6e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  33.48 
 
 		 453 aa  223  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  32.37 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  33.11 
 
 		 453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  32.61 
 
 		 517 aa  219  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  33.41 
 
 		 449 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  33.18 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  33.55 
 
 		 443 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 453 aa  217  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  33.71 
 
 		 522 aa  217  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  34.5 
 
 		 441 aa  217  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  33.78 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.4 
 
 		 511 aa  216  7e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  32.1 
 
 		 452 aa  216  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 453 aa  216  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.28 
 
 		 512 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  33.77 
 
 		 515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  32.08 
 
 		 463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  31.89 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  30.7 
 
 		 449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3368  signal recognition particle protein  33.2 
 
 		 550 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  32.89 
 
 		 515 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  30.53 
 
 		 481 aa  213  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  32.88 
 
 		 445 aa  213  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 448 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.66 
 
 		 447 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.11 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  31.69 
 
 		 444 aa  212  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  33.87 
 
 		 491 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1517  Signal recognition particle protein  32.08 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  31.48 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.9 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.97 
 
 		 454 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  30.49 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  30.49 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  30.49 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  30.49 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  30.49 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  32.12 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  31.26 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.48 
 
 		 478 aa  210  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  30.28 
 
 		 449 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  33.89 
 
 		 492 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  33.19 
 
 		 452 aa  209  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  30.28 
 
 		 449 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  31.37 
 
 		 447 aa  209  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  33.57 
 
 		 472 aa  209  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  32.24 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.81 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  30.28 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.86 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  30.28 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  33.93 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  31.4 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  31.82 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  31.98 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  32.47 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  31.98 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  30.87 
 
 		 449 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>