More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26018 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  100 
 
 
513 aa  1048    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  46.37 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  45.56 
 
 
561 aa  424  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  45.23 
 
 
591 aa  420  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  46.19 
 
 
542 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  38.72 
 
 
450 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  38.72 
 
 
450 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  38.32 
 
 
450 aa  329  7e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  38.81 
 
 
450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  41.33 
 
 
444 aa  323  6e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  38.64 
 
 
439 aa  318  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  38.9 
 
 
441 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  38.09 
 
 
450 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  41.5 
 
 
443 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  36.26 
 
 
469 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  37.97 
 
 
446 aa  302  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  37.74 
 
 
440 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.82 
 
 
464 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  36.64 
 
 
443 aa  297  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  36.63 
 
 
437 aa  297  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.38 
 
 
468 aa  295  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.53 
 
 
449 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.34 
 
 
446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  34.95 
 
 
463 aa  286  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.38 
 
 
464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.50914 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.81 
 
 
447 aa  279  7e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  37.47 
 
 
431 aa  279  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  35.63 
 
 
449 aa  274  3e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  34.44 
 
 
433 aa  266  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.43 
 
 
431 aa  265  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  34.29 
 
 
442 aa  256  9e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  34.22 
 
 
433 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  34.07 
 
 
433 aa  252  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.91 
 
 
491 aa  238  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  32.79 
 
 
479 aa  237  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  32.25 
 
 
522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.4 
 
 
527 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  32.88 
 
 
455 aa  232  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  33.11 
 
 
455 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  33.47 
 
 
536 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  33.11 
 
 
455 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.29 
 
 
512 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  33.26 
 
 
463 aa  230  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  33.48 
 
 
525 aa  230  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  32.42 
 
 
451 aa  230  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  32.52 
 
 
515 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  32.83 
 
 
449 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  32.63 
 
 
518 aa  229  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  31.39 
 
 
476 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.01 
 
 
551 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  30.5 
 
 
507 aa  228  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  31.71 
 
 
492 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  31.33 
 
 
446 aa  226  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  31.19 
 
 
449 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  33.04 
 
 
518 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  32.8 
 
 
495 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  30.54 
 
 
520 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  32.61 
 
 
452 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  32.17 
 
 
450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  31.75 
 
 
449 aa  223  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.74 
 
 
447 aa  223  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  29.77 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39979  IISP family transporter: signal recognition particle protein (SRP54)  32.58 
 
 
498 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.75 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  30.75 
 
 
512 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  32.01 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  31.76 
 
 
518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  32.82 
 
 
447 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  31.64 
 
 
442 aa  222  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  34 
 
 
461 aa  221  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.36 
 
 
515 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  31.98 
 
 
443 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  31.35 
 
 
435 aa  220  5e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  34 
 
 
467 aa  220  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1165  signal recognition particle protein  32.53 
 
 
532 aa  220  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  32.75 
 
 
527 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.67 
 
 
528 aa  218  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  30.26 
 
 
441 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  31.87 
 
 
544 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  32.45 
 
 
453 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.4 
 
 
511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  30.07 
 
 
439 aa  217  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  30.41 
 
 
433 aa  217  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  31.18 
 
 
515 aa  217  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.94 
 
 
529 aa  217  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  29.91 
 
 
444 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.38 
 
 
481 aa  216  7e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  31.07 
 
 
449 aa  216  7e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  30.56 
 
 
492 aa  216  8e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.7 
 
 
530 aa  216  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  33.17 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  28.24 
 
 
521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  29.91 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  29.95 
 
 
433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2089  signal recognition particle protein  31.38 
 
 
443 aa  214  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00342036  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  30.31 
 
 
443 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  32.81 
 
 
455 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  29.76 
 
 
446 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  31.57 
 
 
452 aa  213  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  30.2 
 
 
508 aa  213  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>