More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1260 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 		 450 aa  894    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  79.11 
 
 		 450 aa  693    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  78.67 
 
 		 450 aa  709    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  79.33 
 
 		 450 aa  718    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  80 
 
 		 450 aa  723    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  50.11 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  48.76 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  47.67 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  46.97 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  49.43 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  47.23 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  47.83 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  48.55 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  46.96 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  43.95 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.35 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  48.26 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.7 
 
 		 464 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.4 
 
 		 464 aa  362  6e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.76 
 
 		 468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  44.04 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.5 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  42.43 
 
 		 433 aa  352  8.999999999999999e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  41.08 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.24 
 
 		 431 aa  338  8e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  40.72 
 
 		 431 aa  335  7e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  40.71 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  41.36 
 
 		 510 aa  326  4.0000000000000003e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  39.25 
 
 		 513 aa  323  5e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  41.1 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  41.2 
 
 		 542 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.48 
 
 		 481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  40.32 
 
 		 561 aa  311  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  36.78 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  39.91 
 
 		 447 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  42.76 
 
 		 446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  39.31 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.53 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  39.31 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  41.1 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  37.56 
 
 		 445 aa  303  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.24 
 
 		 449 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  36.72 
 
 		 450 aa  302  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  39.05 
 
 		 446 aa  302  9e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  38.55 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  40.33 
 
 		 520 aa  299  5e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  39.86 
 
 		 469 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.07 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  39.13 
 
 		 591 aa  298  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  38.16 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  39.76 
 
 		 449 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  36.57 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  39.17 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  39.03 
 
 		 449 aa  297  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  39.17 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  40 
 
 		 451 aa  297  3e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  37.72 
 
 		 444 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  39.1 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  36.02 
 
 		 508 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  38.15 
 
 		 521 aa  295  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  37.95 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  37.73 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.05 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  39.15 
 
 		 446 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  41.33 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  37.41 
 
 		 449 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  39.4 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  40.62 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  38.33 
 
 		 448 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  38.59 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  37.12 
 
 		 448 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  36.34 
 
 		 449 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  38.16 
 
 		 439 aa  290  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  40.52 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.07 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  38.55 
 
 		 461 aa  289  6e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  38.63 
 
 		 445 aa  289  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  37.83 
 
 		 452 aa  289  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  36.7 
 
 		 485 aa  289  7e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  35.91 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  37.05 
 
 		 449 aa  289  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  37.56 
 
 		 449 aa  289  9e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  39 
 
 		 467 aa  289  9e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  38.08 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  37.62 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  38.05 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  38.94 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.03 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  38 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  39.6 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  39.6 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.77 
 
 		 512 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.33 
 
 		 507 aa  286  4e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  37.13 
 
 		 442 aa  286  4e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  37.2 
 
 		 493 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  34.41 
 
 		 447 aa  286  5e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  37.56 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  35.51 
 
 		 512 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  36.95 
 
 		 453 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.07 
 
 		 490 aa  286  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>