More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0531 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 		 442 aa  896    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  45.84 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  44.47 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  43.79 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  44.02 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  44.04 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  45.83 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  44.24 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  44.47 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  46.15 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  44.24 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  43.82 
 
 		 437 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  43.29 
 
 		 433 aa  354  1e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  43.44 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.76 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  42.95 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  42.6 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.05 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  43.75 
 
 		 447 aa  339  5e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  41 
 
 		 433 aa  339  8e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  43.12 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  40.55 
 
 		 440 aa  332  6e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  40.79 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.55 
 
 		 464 aa  319  6e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.5 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.67 
 
 		 469 aa  315  8e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.06 
 
 		 464 aa  310  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.76 
 
 		 468 aa  298  9e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  36.98 
 
 		 450 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  37.59 
 
 		 447 aa  289  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  36.77 
 
 		 443 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  37.99 
 
 		 444 aa  282  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.14 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  36.26 
 
 		 561 aa  279  6e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  35.63 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.67 
 
 		 443 aa  275  8e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  34.3 
 
 		 513 aa  275  9e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  35.63 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  35.76 
 
 		 455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  35.88 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  35.2 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  36 
 
 		 542 aa  273  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  37.47 
 
 		 443 aa  273  6e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  35.49 
 
 		 521 aa  272  7e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  36.2 
 
 		 455 aa  272  9e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  36.2 
 
 		 455 aa  272  9e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  35.66 
 
 		 463 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf350  signal recognition particle  36.88 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.826641  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  34.27 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  35.21 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  35.28 
 
 		 485 aa  271  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  37.12 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  35.57 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  34.52 
 
 		 479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.19 
 
 		 481 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  36.18 
 
 		 510 aa  270  4e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  35.75 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  35.46 
 
 		 591 aa  270  5e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  34.95 
 
 		 450 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.62 
 
 		 456 aa  269  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2089  signal recognition particle protein  35.73 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00342036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.27 
 
 		 490 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.4 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.01 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  34.42 
 
 		 508 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.82 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  36.81 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  35.67 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  37.06 
 
 		 449 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  36.32 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  36.09 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  35.44 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35185  predicted protein  35.36 
 
 		 448 aa  266  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  36.24 
 
 		 459 aa  266  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14851  signal recognition particle protein (SRP54)  35.47 
 
 		 498 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  37.01 
 
 		 451 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1382  signal recognition particle protein  35.47 
 
 		 489 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.91 
 
 		 551 aa  265  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  34.11 
 
 		 449 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  36.57 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  36.55 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.12 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  34.75 
 
 		 520 aa  264  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  36.47 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  37 
 
 		 446 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14711  signal recognition particle protein (SRP54)  35.33 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.657856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  35.94 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  38.24 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  35.88 
 
 		 476 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  34.73 
 
 		 449 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  34.58 
 
 		 487 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.53 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  34.88 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  35.46 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  33.87 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  35.15 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  35.68 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14471  signal recognition particle protein (SRP54)  34.73 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  35.66 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  34.32 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>