More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1474 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 		 446 aa  903    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  70.18 
 
 		 441 aa  634  1e-180  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  69.61 
 
 		 443 aa  625  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  68.65 
 
 		 437 aa  624  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  68.97 
 
 		 440 aa  620  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  59.73 
 
 		 439 aa  545  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  58.54 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  56.04 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.14 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  50.9 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  52.31 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  52.31 
 
 		 463 aa  431  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  49.55 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  48.31 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  47.64 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  49.1 
 
 		 468 aa  423  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  47.42 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  46.97 
 
 		 450 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  48.09 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.93 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  45.83 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  43.02 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  38.78 
 
 		 449 aa  330  4e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  43.86 
 
 		 447 aa  325  7e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  41.74 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.33 
 
 		 431 aa  319  6e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  40.83 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  41.51 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  38.05 
 
 		 513 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  39.95 
 
 		 542 aa  298  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  41.03 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  40.43 
 
 		 561 aa  291  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  40.52 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  38.16 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  38.19 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  39.62 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  38.19 
 
 		 449 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  38.19 
 
 		 449 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  38.19 
 
 		 449 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  38.19 
 
 		 449 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  38.43 
 
 		 476 aa  288  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  38.19 
 
 		 449 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  37.16 
 
 		 479 aa  286  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  39.33 
 
 		 591 aa  286  5e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  37.96 
 
 		 449 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  37.96 
 
 		 449 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.98 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  37.96 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  37.96 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  37.96 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  38.17 
 
 		 449 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  38.35 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  37.78 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  36.38 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.17 
 
 		 449 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  37.89 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  35.83 
 
 		 450 aa  279  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  37 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.53 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  36.45 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.77 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  36.48 
 
 		 449 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  36.13 
 
 		 445 aa  276  8e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  37.7 
 
 		 449 aa  275  8e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  36.75 
 
 		 444 aa  275  8e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  37.94 
 
 		 451 aa  273  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  36.34 
 
 		 443 aa  274  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  35.87 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  37.31 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  36.94 
 
 		 449 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  36.13 
 
 		 446 aa  272  9e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  36.26 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  37.15 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  36.03 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  37.09 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  37.09 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  36.71 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  36.34 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.33 
 
 		 512 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.9 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  35.87 
 
 		 448 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  37.09 
 
 		 453 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  34.89 
 
 		 444 aa  269  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  36.4 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  36.4 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  35.46 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  35.13 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  34.68 
 
 		 508 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  37.33 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  35.87 
 
 		 492 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  36.53 
 
 		 489 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  35.36 
 
 		 463 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  35.75 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  36.07 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.19 
 
 		 447 aa  266  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.48 
 
 		 551 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  35.43 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.14 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.78 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  34.68 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>