More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0544 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  72.48 
 
 		 437 aa  658    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  74.15 
 
 		 441 aa  677    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 		 440 aa  895    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  77.27 
 
 		 443 aa  691    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  68.97 
 
 		 446 aa  620  1e-176  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  60.5 
 
 		 439 aa  557  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  60 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  57.99 
 
 		 444 aa  528  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.93 
 
 		 469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  52.27 
 
 		 464 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  52.18 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  48.95 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  52.18 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  49.42 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  48.36 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  50.91 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  47.23 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  48.72 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  49.3 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.06 
 
 		 446 aa  359  6e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  42.79 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  37.92 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  40.55 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.83 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  38.86 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  39.86 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.2 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  39.51 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  37.89 
 
 		 513 aa  300  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  39.35 
 
 		 510 aa  300  3e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  38.88 
 
 		 443 aa  295  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  38.14 
 
 		 561 aa  280  3e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  38.25 
 
 		 591 aa  278  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  38.24 
 
 		 436 aa  276  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  35.89 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  38.79 
 
 		 542 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.9 
 
 		 446 aa  267  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.56 
 
 		 447 aa  266  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  35.45 
 
 		 444 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  35.49 
 
 		 479 aa  265  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  36.43 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  34.91 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.59 
 
 		 449 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  35.92 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  35.2 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  35.89 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  34.75 
 
 		 444 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  33.78 
 
 		 439 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  34.68 
 
 		 476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.25 
 
 		 512 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  34.31 
 
 		 450 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.96 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  36.56 
 
 		 446 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  34.68 
 
 		 449 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  34 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  36.89 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  35.12 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  37.09 
 
 		 453 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.6 
 
 		 481 aa  250  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  35.05 
 
 		 445 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  35.98 
 
 		 492 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  32.66 
 
 		 440 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.56 
 
 		 443 aa  249  5e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  35.98 
 
 		 492 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  33.41 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  34.68 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  36.67 
 
 		 458 aa  249  9e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  33.49 
 
 		 492 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  35.47 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  34.79 
 
 		 488 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  35.05 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  34.22 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  35.4 
 
 		 447 aa  247  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  33.18 
 
 		 518 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  34.02 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.8 
 
 		 490 aa  247  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  34.74 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  33.79 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  34.57 
 
 		 485 aa  246  6.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.09 
 
 		 454 aa  245  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  34.08 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  33.11 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  33.49 
 
 		 512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  34.76 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  30.02 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  33.56 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  33.63 
 
 		 521 aa  243  5e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  33.18 
 
 		 508 aa  243  7e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  34.46 
 
 		 491 aa  242  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  33.33 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2279  signal recognition particle protein  35.45 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000146943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  33.02 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0047  signal recognition particle protein  34.78 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0057  signal recognition particle protein  35.01 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.201387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  33.63 
 
 		 520 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>