More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_73416 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  100 
 
 		 561 aa  1148    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  53.49 
 
 		 542 aa  506  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  54.94 
 
 		 591 aa  502  1e-141  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  48.11 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  41.02 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  39 
 
 		 450 aa  315  9e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  39 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  39.96 
 
 		 444 aa  312  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  40.32 
 
 		 450 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.99 
 
 		 446 aa  311  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  38.8 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  40.43 
 
 		 443 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  39.12 
 
 		 439 aa  299  8e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.98 
 
 		 468 aa  299  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.69 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.8 
 
 		 469 aa  297  4e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  38.8 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.73 
 
 		 447 aa  293  5e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  40.19 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  37.44 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  37.72 
 
 		 437 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  37.5 
 
 		 443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  37.33 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  37.88 
 
 		 440 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.47 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  36.6 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.27 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.55 
 
 		 431 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  33.04 
 
 		 433 aa  267  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  34.44 
 
 		 433 aa  264  3e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  33.78 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  34.35 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  35.98 
 
 		 442 aa  256  6e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  33.77 
 
 		 522 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  32.82 
 
 		 450 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  34 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.1 
 
 		 481 aa  237  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  35.39 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  34 
 
 		 450 aa  236  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  32.88 
 
 		 512 aa  236  9e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  35.39 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  34.68 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.11 
 
 		 512 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  32.08 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.12 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  35.46 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  35.57 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  32.89 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  31.69 
 
 		 521 aa  230  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  35.46 
 
 		 453 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  34.15 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  33.26 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  30.47 
 
 		 535 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  34.16 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.25 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  32.11 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  33.18 
 
 		 444 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  30.91 
 
 		 443 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  34.29 
 
 		 476 aa  227  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  34.08 
 
 		 433 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  30.72 
 
 		 525 aa  226  7e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  31.55 
 
 		 528 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  34.1 
 
 		 449 aa  226  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  33.41 
 
 		 433 aa  225  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.46 
 
 		 449 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.1 
 
 		 496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  30.47 
 
 		 551 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  32.72 
 
 		 447 aa  223  6e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  32.65 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  32.34 
 
 		 442 aa  223  7e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  33.94 
 
 		 451 aa  223  7e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  33.33 
 
 		 443 aa  223  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  31.83 
 
 		 518 aa  223  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  32.46 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  30.68 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  31.99 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.18 
 
 		 443 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.74 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  31.51 
 
 		 508 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.52 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.52 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  31.38 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.52 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  32.37 
 
 		 441 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1440  signal recognition particle protein  31.97 
 
 		 450 aa  220  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.627334  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  34.66 
 
 		 435 aa  220  6e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  32.76 
 
 		 435 aa  220  6e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  32.17 
 
 		 492 aa  220  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  31.08 
 
 		 515 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  31.56 
 
 		 479 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  31.8 
 
 		 449 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  31.8 
 
 		 449 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  31.8 
 
 		 449 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  31.8 
 
 		 449 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0328  signal recognition particle protein  30.84 
 
 		 556 aa  219  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.59605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  32.18 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  31.8 
 
 		 449 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.1 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  33.7 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  32.51 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>