More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0918 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 		 443 aa  899    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  75.85 
 
 		 439 aa  686    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  67.12 
 
 		 444 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  60 
 
 		 440 aa  549  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  60.18 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  58.43 
 
 		 441 aa  535  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  58.77 
 
 		 446 aa  537  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  56.85 
 
 		 437 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  54.83 
 
 		 469 aa  488  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  54.73 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  52.83 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.35 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  54.97 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  49.43 
 
 		 450 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  49.43 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  49.2 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  49.66 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  48.28 
 
 		 450 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  48.74 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  44.93 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.31 
 
 		 446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  42.18 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  43.46 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.41 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  40.13 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  41.94 
 
 		 433 aa  338  9e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.28 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  40.76 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  41.89 
 
 		 513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  40.53 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  40.31 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  40.84 
 
 		 561 aa  310  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  40.49 
 
 		 445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  40 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  39.02 
 
 		 510 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  41.13 
 
 		 446 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  39.02 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.19 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  39.26 
 
 		 450 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  39.58 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  41.03 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  41.72 
 
 		 436 aa  295  7e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  39.09 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  39.86 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  39.58 
 
 		 495 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  38.51 
 
 		 447 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  40.56 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  38.9 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  39.13 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  39.13 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  39.13 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  39.13 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  39.13 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  39.13 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  39.13 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  39.57 
 
 		 435 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  39.35 
 
 		 452 aa  289  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  38.94 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  37.9 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  39.36 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  40.61 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  38.9 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  39.1 
 
 		 591 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  38.8 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  38.9 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  37.81 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.13 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  37.18 
 
 		 488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  37.36 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  39.43 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  37.86 
 
 		 449 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  37.27 
 
 		 463 aa  286  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  38.29 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  39.29 
 
 		 439 aa  286  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  38.22 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  37.39 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  36.98 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  37.61 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  38.8 
 
 		 453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.14 
 
 		 490 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  37.16 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  36.45 
 
 		 485 aa  282  8.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  37.12 
 
 		 508 aa  282  9e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  38.34 
 
 		 434 aa  282  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.05 
 
 		 512 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  36.47 
 
 		 518 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  37.16 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  37.05 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.84 
 
 		 530 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  38.82 
 
 		 514 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  39.24 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.77 
 
 		 447 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  37.69 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  36.55 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  38.46 
 
 		 458 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  37.7 
 
 		 493 aa  279  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1373  signal recognition particle protein Ffh  38.76 
 
 		 457 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3402  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.13 
 
 		 458 aa  279  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15960  signal recognition particle protein Ffh  38.44 
 
 		 457 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144741  normal  0.536445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.31 
 
 		 551 aa  279  7e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>