More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0181 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  100 
 
 		 491 aa  995    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  52.17 
 
 		 518 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  51.83 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  51.28 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  50.93 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  51.16 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.55 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  52.37 
 
 		 469 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  49.88 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  50.93 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  50.33 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  51.97 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  48.75 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  51.49 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  50.81 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  50.92 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 508 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.78 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  47.13 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  46.58 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.58 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  51.03 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.3 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  47.26 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  49.42 
 
 		 455 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  50 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  50 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  50 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  50 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  49 
 
 		 451 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  50 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  49.65 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  51.15 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  50 
 
 		 453 aa  422  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  48.28 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.12 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  47.91 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  47.93 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  51.04 
 
 		 452 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  47.39 
 
 		 493 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.1 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  47.86 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  48.5 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  46.98 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  48.81 
 
 		 448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.68 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  49.53 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  48.93 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  47.1 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.02 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  50.83 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  50.83 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.21 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  46.99 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  49.16 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  45.14 
 
 		 440 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  47.83 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  48.97 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  47.83 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  46.74 
 
 		 485 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  48.42 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  44.6 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.44 
 
 		 492 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  47.14 
 
 		 434 aa  395  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.33 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  45.48 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  47.5 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.33 
 
 		 483 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  48.38 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  46.51 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  47.05 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  47.37 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  44.42 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  48.11 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  47.28 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  47.28 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.83 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.17 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  46.17 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  45.71 
 
 		 489 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  46.78 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  47.11 
 
 		 515 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  45.27 
 
 		 528 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  45.83 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  44.97 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  47.52 
 
 		 518 aa  386  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.1 
 
 		 551 aa  388  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>