More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1006 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2279  signal recognition particle protein  83.6 
 
 		 435 aa  729    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000146943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1006  signal recognition particle protein  100 
 
 		 434 aa  868    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0974  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1440  signal recognition particle protein  62.5 
 
 		 450 aa  558  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.627334  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  51.55 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.16 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 443 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  50.69 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  50.34 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.67 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  49.77 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.39 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  50.83 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  50.82 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  49.3 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  49.3 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  49.53 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  49.53 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  50.45 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  49.88 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  48.63 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.33 
 
 		 452 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  48.62 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.73 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  48.4 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  49.3 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  49.04 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.87 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  47.03 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  49.53 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  47.9 
 
 		 449 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  47.57 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.76 
 
 		 462 aa  398  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  48.58 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.12 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.19 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  50.58 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  47.74 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  47.13 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  47.54 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  48.09 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  48.2 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  48.05 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  48.52 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  48.37 
 
 		 450 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.45 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12930  signal recognition particle protein ffh  48.16 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.569051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  46.8 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  48.72 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  48.19 
 
 		 508 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  47.33 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  47.6 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  46.9 
 
 		 524 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  44.32 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.26 
 
 		 478 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  47.39 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  47.14 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  46.98 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  48.16 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  47.91 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  47.03 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 454 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 454 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2243  signal recognition particle protein  46.68 
 
 		 519 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739942  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  47.92 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  46.62 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  45.93 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  47.93 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.83 
 
 		 520 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  45.23 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.83 
 
 		 520 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  47.01 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  45.45 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.22 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.83 
 
 		 520 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.92 
 
 		 528 aa  385  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  44.95 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  44.87 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3143  signal recognition particle protein  47.1 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00382292  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  45.9 
 
 		 525 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  46.58 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  47.65 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09950  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.33 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0229355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  46.58 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  45.87 
 
 		 504 aa  378  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  46.98 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.84 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.23 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.33 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>