296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0943 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  98.59 
 
 		 1209 bp  2262    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0965  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  89.15 
 
 		 2007 bp  1768    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    100 
 
 		 3399 bp  6738    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1002  diguanylate cyclase  89.31 
 
 		 2094 bp  1784    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  87.55 
 
 		 1155 bp  991    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  100 
 
 		 1209 bp  2397    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  85.03 
 
 		 1212 bp  281  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5435  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  81.66 
 
 		 2028 bp  236  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.620529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  82.39 
 
 		 1209 bp  206  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  82.39 
 
 		 1209 bp  206  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  82.39 
 
 		 1209 bp  206  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  188  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  188  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  188  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  188  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  188  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  188  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 399 bp  155  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4173    88.6 
 
 		 174 bp  123  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0158    100 
 
 		 1045 bp  101  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  86.73 
 
 		 1197 bp  91.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  88.31 
 
 		 1200 bp  81.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  88.31 
 
 		 1200 bp  81.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1925    89.71 
 
 		 596 bp  79.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    87.84 
 
 		 723 bp  75.8  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 		 1722 bp  73.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0969202  normal  0.0933815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2272  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  95.45 
 
 		 2340 bp  71.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2375  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  95.45 
 
 		 2373 bp  71.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4344  diguanylate cyclase  88.24 
 
 		 1110 bp  71.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0183    92.16 
 
 		 178 bp  69.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  86.67 
 
 		 1200 bp  69.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2775    87.88 
 
 		 319 bp  67.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0689  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and periplasmic/7TM domain sensor(s)  95.24 
 
 		 2898 bp  67.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0632  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  95.24 
 
 		 2898 bp  67.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0919464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0518  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 		 1740 bp  67.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  81.97 
 
 		 1014 bp  67.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4175  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  95.24 
 
 		 3252 bp  67.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  93.48 
 
 		 3306 bp  67.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  93.48 
 
 		 3444 bp  67.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7007  hypothetical protein  84.38 
 
 		 237 bp  67.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0845  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  100 
 
 		 2640 bp  67.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  87.69 
 
 		 1200 bp  65.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  87.69 
 
 		 1200 bp  65.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0984  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  97.3 
 
 		 2880 bp  65.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3968  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  97.3 
 
 		 2664 bp  65.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  87.69 
 
 		 1200 bp  65.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5603  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  97.3 
 
 		 2502 bp  65.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748206  normal  0.248656 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2221  EAL/GGDEF domain-containing protein  91.67 
 
 		 2361 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4193  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  100 
 
 		 2112 bp  63.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.519215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3702  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  97.22 
 
 		 2592 bp  63.9  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1191  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  97.22 
 
 		 2511 bp  63.9  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.668547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1311  hypothetical protein  91.67 
 
 		 2361 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432908  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  100 
 
 		 2103 bp  63.9  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7111  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  91.67 
 
 		 2142 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.473788 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5693  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  93.18 
 
 		 2193 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4536  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  97.22 
 
 		 2331 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.51546  normal  0.843042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  93.18 
 
 		 1608 bp  63.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1742  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  93.18 
 
 		 2373 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.451228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  93.18 
 
 		 2340 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1310  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  95 
 
 		 2139 bp  63.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2354  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  93.18 
 
 		 2373 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  93.18 
 
 		 2337 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3306  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  97.22 
 
 		 2652 bp  63.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.660449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0706  EAL/GGDEF domain-containing protein  91.67 
 
 		 2361 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2540  EAL/GGDEF domain-containing protein  91.67 
 
 		 2361 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1151  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  91.67 
 
 		 2319 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1160  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  91.67 
 
 		 2319 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0890  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  97.22 
 
 		 1968 bp  63.9  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.191465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2074  EAL/GGDEF domain-containing protein  91.67 
 
 		 2361 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  97.22 
 
 		 4455 bp  63.9  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.978359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1106  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  97.22 
 
 		 2193 bp  63.9  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1037  sensory box/response regulator  100 
 
 		 2400 bp  61.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00530  hypothetical protein with two C-terminal GGDEF motifs  94.87 
 
 		 2160 bp  61.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.409537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    87.3 
 
 		 1271 bp  61.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0948  EAL/GGDEF domain-containing protein  97.14 
 
 		 2361 bp  61.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4644  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  97.14 
 
 		 2715 bp  61.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.374969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1464  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  97.14 
 
 		 2553 bp  61.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0597049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0834  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  94.87 
 
 		 2496 bp  61.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.153138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1344  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  97.14 
 
 		 2511 bp  61.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.492796  normal  0.0418259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1614  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  97.14 
 
 		 2316 bp  61.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0431388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4412  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 		 1725 bp  60  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0317543  normal  0.165306 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2189  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  92.86 
 
 		 2190 bp  60  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4312  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  97.06 
 
 		 2250 bp  60  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165307  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  97.06 
 
 		 2250 bp  60  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771777  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  83.72 
 
 		 2058 bp  60  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3955  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  97.06 
 
 		 2250 bp  60  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298684  normal  0.0854397 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4054  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  97.06 
 
 		 2250 bp  60  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>