77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1573 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0352    87.43 
 
 		 1213 bp  1197    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  87.36 
 
 		 1233 bp  1185    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  87.36 
 
 		 1233 bp  1185    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    100 
 
 		 1271 bp  2520    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  87.36 
 
 		 1233 bp  1185    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  87.36 
 
 		 1233 bp  1185    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  80.45 
 
 		 1233 bp  452  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  80.45 
 
 		 1233 bp  452  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  80.45 
 
 		 1233 bp  452  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2959    82.82 
 
 		 425 bp  133  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  85.19 
 
 		 1236 bp  109  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  85.19 
 
 		 1236 bp  109  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5979  transposase, mutator type  86.07 
 
 		 1176 bp  107  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.640572 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5576  transposase, mutator type  86.07 
 
 		 1203 bp  107  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5755  transposase, mutator type  84.44 
 
 		 1236 bp  101  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5359  transposase, mutator type  84.44 
 
 		 1236 bp  101  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0615    81.12 
 
 		 1229 bp  87.7  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1892    89.04 
 
 		 3611 bp  81.8  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1895    89.04 
 
 		 1291 bp  81.8  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0630  transposase, mutator type  93.33 
 
 		 1086 bp  79.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10440  Transposase, Mutator family  86.59 
 
 		 1269 bp  75.8  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000572407  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10460  Transposase, Mutator family  86.59 
 
 		 1269 bp  75.8  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000746086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13468  transposase  83.81 
 
 		 846 bp  73.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0327912  hitchhiker  0.000514012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13950    85.37 
 
 		 123 bp  67.9  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  88.71 
 
 		 1230 bp  67.9  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  81.97 
 
 		 1260 bp  67.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  81.97 
 
 		 1260 bp  67.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  81.97 
 
 		 1260 bp  67.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    87.3 
 
 		 3399 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  85.33 
 
 		 1236 bp  61.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  87.3 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1165    87.84 
 
 		 905 bp  60  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  86.15 
 
 		 1209 bp  58  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  86.15 
 
 		 1209 bp  58  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  86.15 
 
 		 1209 bp  58  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  90.91 
 
 		 1200 bp  56  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  90.91 
 
 		 1200 bp  56  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    90.91 
 
 		 1184 bp  56  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  85.71 
 
 		 1200 bp  54  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1634    86.57 
 
 		 1113 bp  54  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  85.71 
 
 		 1200 bp  54  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  85.07 
 
 		 1248 bp  54  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  85.07 
 
 		 1248 bp  54  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5004    85.71 
 
 		 477 bp  54  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  86.21 
 
 		 1200 bp  52  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  90.48 
 
 		 927 bp  52  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  90.48 
 
 		 927 bp  52  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    90.48 
 
 		 228 bp  52  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  96.67 
 
 		 1197 bp  52  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  86.21 
 
 		 1200 bp  52  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  86.21 
 
 		 1200 bp  52  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    86.21 
 
 		 723 bp  52  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  84.62 
 
 		 1209 bp  50.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  84.62 
 
 		 1209 bp  50.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  84.62 
 
 		 1209 bp  50.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1655  hypothetical protein  91.67 
 
 		 270 bp  48.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.549221  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  88.64 
 
 		 1212 bp  48.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  88.64 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  88.64 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  88.64 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  96.43 
 
 		 1212 bp  48.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  96.43 
 
 		 1212 bp  48.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0547    91.67 
 
 		 420 bp  48.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>