More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3910 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  82.99 
 
 		 399 aa  692    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  100 
 
 		 399 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  100 
 
 		 399 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  85.46 
 
 		 399 aa  685    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  84.46 
 
 		 399 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  84.46 
 
 		 399 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  83.71 
 
 		 399 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  83.71 
 
 		 399 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  82.99 
 
 		 399 aa  692    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  84.46 
 
 		 399 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  67.17 
 
 		 398 aa  549  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  67.17 
 
 		 398 aa  549  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  67.17 
 
 		 398 aa  549  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  67.17 
 
 		 398 aa  549  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  67.17 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  69.19 
 
 		 398 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  82.41 
 
 		 308 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  82.41 
 
 		 308 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  63.82 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  59.7 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  59.7 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  59.7 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  59.7 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  59.7 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  59.45 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  62.69 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  62.69 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  62.69 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  59.06 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  60.94 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  82.63 
 
 		 266 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  54.47 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  54.47 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  54.47 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1511  transposase mutator type  54.47 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.647595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0112  transposase mutator type  54.47 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1531  transposase mutator type  54.47 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  54.47 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  79.41 
 
 		 337 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  55.5 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  55.5 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  55.5 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  55.5 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  55.5 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  55.5 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  55.5 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  55.5 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  55.5 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  59.28 
 
 		 384 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  53.63 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  53.63 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  53.63 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  53.63 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  53.07 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  53.07 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  53.07 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  51.05 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  49.87 
 
 		 411 aa  361  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  49.87 
 
 		 411 aa  361  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5755  transposase, mutator type  49.09 
 
 		 411 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5359  transposase, mutator type  49.09 
 
 		 411 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  50.13 
 
 		 419 aa  355  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  49.87 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  49.87 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10440  Transposase, Mutator family  47.98 
 
 		 422 aa  350  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000572407  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10460  Transposase, Mutator family  47.98 
 
 		 422 aa  350  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000746086  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  47.91 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  49.6 
 
 		 413 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  49.6 
 
 		 413 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  49.05 
 
 		 415 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  49.05 
 
 		 415 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0700  transposase, mutator type  47.91 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0889  transposase, mutator type  47.91 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2876  transposase, mutator type  47.91 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0688  transposase, mutator type  47 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  48.51 
 
 		 414 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02160  transposase, mutator family  46.44 
 
 		 417 aa  335  5.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  46.44 
 
 		 417 aa  335  5.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  46.44 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  46.44 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  46.44 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  46.44 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  46.44 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00300  transposase, mutator family  46.44 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20500  transposase, mutator family  46.17 
 
 		 417 aa  332  6e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05430  transposase  45.12 
 
 		 416 aa  332  6e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17950  transposase  45.12 
 
 		 416 aa  332  6e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>