46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5004 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5004    100 
 
 		 477 bp  946    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  87.42 
 
 		 1200 bp  321  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  87.42 
 
 		 1200 bp  321  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  87.12 
 
 		 1200 bp  313  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  86.81 
 
 		 1200 bp  305  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  86.81 
 
 		 1200 bp  305  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    84.97 
 
 		 723 bp  258  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  83.28 
 
 		 1200 bp  212  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    82.29 
 
 		 1039 bp  157  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    81.85 
 
 		 694 bp  141  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2775    85.71 
 
 		 319 bp  131  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  81.77 
 
 		 927 bp  109  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  81.77 
 
 		 927 bp  109  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  81.22 
 
 		 1200 bp  97.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  81.22 
 
 		 1200 bp  97.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    81.22 
 
 		 1184 bp  97.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3572    83.58 
 
 		 291 bp  91.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    84.96 
 
 		 228 bp  89.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    82.27 
 
 		 715 bp  81.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  87.5 
 
 		 288 bp  79.8  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  92.45 
 
 		 1200 bp  73.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  92.45 
 
 		 1200 bp  73.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2128  transposase, mutator type  80.11 
 
 		 468 bp  73.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.449064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    92.73 
 
 		 399 bp  69.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6609    83.49 
 
 		 336 bp  65.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    86.36 
 
 		 3399 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  86.36 
 
 		 1209 bp  60  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  80.3 
 
 		 1197 bp  56  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    85.71 
 
 		 1271 bp  54  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1076  transposase mutator type  93.94 
 
 		 1179 bp  50.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0982723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1925    100 
 
 		 596 bp  46.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1065  hypothetical protein  100 
 
 		 1008 bp  46.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>