103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3047 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3047    100 
 
 		 1184 bp  2347    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  96.34 
 
 		 1200 bp  1358    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  96.34 
 
 		 1200 bp  1358    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    89.12 
 
 		 1039 bp  733    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    88.69 
 
 		 694 bp  704    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    90.93 
 
 		 399 bp  502  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2128  transposase, mutator type  86.53 
 
 		 468 bp  414  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.449064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  81.59 
 
 		 1200 bp  329  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    81.79 
 
 		 723 bp  297  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  80.93 
 
 		 1200 bp  293  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  80.93 
 
 		 1200 bp  293  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  80.76 
 
 		 1200 bp  287  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  81.04 
 
 		 1200 bp  276  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  81.04 
 
 		 1200 bp  276  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  86.1 
 
 		 801 bp  260  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  80.27 
 
 		 1200 bp  230  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  80.27 
 
 		 1200 bp  230  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2516  transposase mutator type  84.75 
 
 		 444 bp  228  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6345  transposase mutator type  82.32 
 
 		 558 bp  210  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442764  normal  0.442259 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  85.53 
 
 		 927 bp  196  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  85.53 
 
 		 927 bp  196  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  81.72 
 
 		 1014 bp  192  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    81.52 
 
 		 2705 bp  174  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    83.33 
 
 		 228 bp  123  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2904  transposase  84.15 
 
 		 408 bp  119  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0475    79.12 
 
 		 715 bp  119  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  83.44 
 
 		 288 bp  105  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5004    81.22 
 
 		 477 bp  97.6  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0511261  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0008  putative fragment of transposase protein  89.16 
 
 		 252 bp  93.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0015  putative fragment of transposase protein  89.16 
 
 		 252 bp  93.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0395238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3235    85.19 
 
 		 261 bp  87.7  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257318  normal  0.453735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1438    82.1 
 
 		 457 bp  83.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  88.57 
 
 		 1197 bp  75.8  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2775    91.23 
 
 		 319 bp  73.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  86.42 
 
 		 1197 bp  73.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    86.42 
 
 		 2433 bp  73.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  86.42 
 
 		 1197 bp  73.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  86.42 
 
 		 1197 bp  73.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  86.42 
 
 		 1197 bp  73.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    86.42 
 
 		 2780 bp  73.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  86.42 
 
 		 1197 bp  73.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2275    85.88 
 
 		 123 bp  73.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3134    85.87 
 
 		 214 bp  71.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0102047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  93.48 
 
 		 1233 bp  67.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  93.48 
 
 		 1233 bp  67.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  93.48 
 
 		 1233 bp  67.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  94.87 
 
 		 1212 bp  61.9  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1925    97.14 
 
 		 596 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    93.02 
 
 		 1213 bp  61.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1707  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 189 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181873  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  85.14 
 
 		 1248 bp  60  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  84.42 
 
 		 1248 bp  58  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2468    100 
 
 		 1158 bp  56  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    90.91 
 
 		 1271 bp  56  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  90.7 
 
 		 1233 bp  54  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  90.7 
 
 		 1233 bp  54  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3572    94.29 
 
 		 291 bp  54  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  86.44 
 
 		 1155 bp  54  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  90.7 
 
 		 1233 bp  54  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  90.7 
 
 		 1233 bp  54  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0943    85.96 
 
 		 3399 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  85.96 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  100 
 
 		 1383 bp  48.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2526    93.75 
 
 		 439 bp  48.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  100 
 
 		 1383 bp  48.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  88.64 
 
 		 1236 bp  48.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  88.64 
 
 		 1236 bp  48.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>