40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3245 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  99.92 
 
 		 1197 bp  2365    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    100 
 
 		 2433 bp  2159    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  100 
 
 		 1197 bp  2373    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  100 
 
 		 1197 bp  2373    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  100 
 
 		 1197 bp  2373    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    100 
 
 		 2780 bp  5511    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  100 
 
 		 1197 bp  2373    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  79.07 
 
 		 1200 bp  111  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  79.07 
 
 		 1200 bp  111  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  78.48 
 
 		 1014 bp  89.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2904  transposase  82.42 
 
 		 408 bp  81.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  84.62 
 
 		 1200 bp  79.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  84.62 
 
 		 1200 bp  79.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    86.42 
 
 		 1184 bp  73.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  84.16 
 
 		 1200 bp  73.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  84.16 
 
 		 1200 bp  73.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  84.16 
 
 		 1200 bp  73.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    83.33 
 
 		 1039 bp  71.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    83.84 
 
 		 2705 bp  69.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  93.48 
 
 		 1200 bp  67.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1880    83.17 
 
 		 723 bp  65.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  83.17 
 
 		 1200 bp  65.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    82.69 
 
 		 228 bp  63.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    83.16 
 
 		 694 bp  61.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  80.6 
 
 		 801 bp  60  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  80.43 
 
 		 1200 bp  60  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1892    89.8 
 
 		 3611 bp  58  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1895    89.8 
 
 		 1291 bp  58  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  85.51 
 
 		 927 bp  58  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  85.51 
 
 		 927 bp  58  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2922    84.51 
 
 		 399 bp  54  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  82.22 
 
 		 1155 bp  52  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  90.48 
 
 		 1233 bp  52  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  90.48 
 
 		 1233 bp  52  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  90.48 
 
 		 1233 bp  52  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  50.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  50.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  82.35 
 
 		 1209 bp  50.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0767  hypothetical protein  100 
 
 		 381 bp  50.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  96.55 
 
 		 978 bp  50.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>