62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0899 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0899    100 
 
 
2433 bp  4823    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  100 
 
 
1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  100 
 
 
1197 bp  2159    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  100 
 
 
1197 bp  2159    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  100 
 
 
1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  100 
 
 
1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  100 
 
 
1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  100 
 
 
1197 bp  2159    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    100 
 
 
2780 bp  2159    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  100 
 
 
1197 bp  2159    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  99.91 
 
 
1197 bp  2151    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1723    100 
 
 
2793 bp  2438    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.629246  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  100 
 
 
1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  100 
 
 
1059 bp  2099    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  79.96 
 
 
1035 bp  190  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  81.48 
 
 
1038 bp  178  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  84.5 
 
 
633 bp  151  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  79.07 
 
 
1200 bp  111  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  79.07 
 
 
1200 bp  111  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3109    84.43 
 
 
234 bp  91.7  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5006  transposase mutator type  78.48 
 
 
1014 bp  89.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570221  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8708    83.61 
 
 
600 bp  83.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.393425  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2904  transposase  82.42 
 
 
408 bp  81.8  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    86.42 
 
 
1184 bp  73.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    83.33 
 
 
1039 bp  71.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  89.06 
 
 
1200 bp  71.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  89.06 
 
 
1200 bp  71.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    83.84 
 
 
2705 bp  69.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  93.48 
 
 
1200 bp  67.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 
1041 bp  65.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 
1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 
1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6928    83.62 
 
 
237 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768318  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 
1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 
1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 
1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  86.11 
 
 
1044 bp  63.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  80.43 
 
 
1200 bp  60  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  80.6 
 
 
801 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  91.3 
 
 
1200 bp  60  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1895    89.8 
 
 
1291 bp  58  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1892    89.8 
 
 
3611 bp  58  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  79.6 
 
 
1200 bp  58  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  94.59 
 
 
1050 bp  58  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  79.6 
 
 
1200 bp  58  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  85.51 
 
 
927 bp  58  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  85.51 
 
 
927 bp  58  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0726    90.91 
 
 
197 bp  56  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0513719  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0553  putative transposase  90.91 
 
 
324 bp  56  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0575438  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0627  integrase, catalytic region  90.91 
 
 
288 bp  56  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000721298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2051  ChnZ  90.91 
 
 
288 bp  56  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1699    90.91 
 
 
324 bp  56  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7487  putative transposase  81.08 
 
 
162 bp  54  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  90.48 
 
 
1233 bp  52  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  90.48 
 
 
1233 bp  52  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  90.48 
 
 
1233 bp  52  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2565    85.48 
 
 
228 bp  52  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  82.22 
 
 
1155 bp  52  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  82.35 
 
 
1209 bp  50.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  82.35 
 
 
1209 bp  50.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  82.35 
 
 
1209 bp  50.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  79.1 
 
 
1200 bp  50.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>